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摘要
运用Illumina MiSeq高通量测序方法对霍山石斛菌根真菌ITS1-2区进行测序,采用Mothur分析三种类型的一年生霍山石斛菌根真菌的菌群多样性、差异性及群落结构组成。结果显示,霍山石斛样品中共得到898 663条ITS rRNA序列,1 928个OTUs;三种类型的一年生霍山石斛(ⅠR1、ⅡR1、ⅢR1)菌根真菌的平均Shannon指数分别为2.42、2.79、2.74;菌根真菌多样性丰富,主要包括子囊菌门、担子菌门、毛霉门三个门,其中5月份霍山石斛中子囊菌门的丰度最大,担子菌门的丰度最小;LEfSe分析发现三种类型的一年生霍山石斛菌根真菌有44个差异丰富的分类学分支(a=0.01,LDA Score≥2.0)。
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