拟南芥和玉米中膜结合bHLH转录因子的鉴定与分析

作者:丁冬; 李嘉欣; 魏玉磊; 吕尤; 赵训超; 刘梦; 邵文静; 盖胜男; 张今杰; 徐晶宇*
来源:植物生理学报, 2020, 56(04): 700-710.
DOI:10.13592/j.cnki.ppj.2019.0502

摘要

碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子是一类重要的转录因子,在逆境胁迫响应中起着重要的调控作用。本研究利用5个不同的网站预测拟南芥(Arabidopsis thaliana)和玉米(Zea mays)中的膜结合bHLH转录因子及其跨膜区,并对它们的进化关系、基因结构、保守结构域、启动子顺式作用元件及逆境表达模式等进行了分析。结果表明, 5个网站中预测到的58个假定的膜结合bHLH转录因子(包括22个AtbHLHs和36个ZmbHLHs)被分成2个亚组,相同亚组的膜结合成员在结构及不同发育阶段的表达模式等方面相似;启动子分析及非生物逆境下转录组数据分析表明这些膜结合成员在非生物胁迫响应过程中发挥重要作用。目前对拟南芥和玉米中膜结合bHLH转录因子的研究较少,本文拟为深入研究膜结合AtbHLHs和ZmbHLHs的功能提供参考。