南瓜HSP70蛋白家族的鉴定和生物信息学分析

作者：胡艳平; 周扬; 云天海; 朱白婢; 王敏; 张文^*

来源：北方园艺, 2019, (17): 7-13.

DOI：10.11937/bfyy.20184654

• 南瓜
• 热激蛋白70
• 生物信息学
• 启动子分析

热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)是植物应对逆境胁迫产生的一类特定的应激蛋白。以南瓜基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对南瓜HSP70基因家族进行鉴定分析,并对蛋白特征、基因结构、保守结构域和启动子序列进行研究。结果表明:南瓜基因组数据库中含有10个HSP70,编码的蛋白序列长度为572～843个氨基酸,HSP70蛋白含有6～8个保守结构域,可分为4个亚家族。基因结构分析表明HSP70具有0～8个内含子。启动子元件分析显示HSP70的启动子含有多个信号元件,说明HSP70可能参与多种功能的调控。研究结果为下一步研究HSP70家族蛋白的功能奠定基础。

• 单位
  海南省农业科学院蔬菜研究所; 海南大学