DNA条形码在三峡库区鱼类多样性研究中的应用

作者：贺杨; 陈文俊; 陈洁琼; 曾文文; 张雪晶; 杨婷; 翟东东; 刘红艳; 熊飞; 王莹^*

来源：四川动物, 2023, 42(05): 508-518.

• DNA条形码
• 三峡库区
• 物种鉴定
• 遗传多样性

为了探讨DNA条形码在三峡库区鱼类辅助物种鉴定中的适用性，本研究通过在三峡库区大规模采样，共采集鱼类标本18 466尾，PCR扩增了其中946尾标本的COⅠ基因序列（639 bp），在NCBI和BOLD数据库中比对鉴定出71个物种，隶属于6目14科55属，其中5个为未命名种，鉴定率为93%；种间遗传距离（6.88%）是种内遗传距离（0.36%）的19.11倍；贝叶斯系统进化树显示，71个物种各自聚为一支且具有高的支持率（PP=1.00）。遗传多样性分析显示，三峡库区中鲢Hypophthalmichthys molitrix、瓦氏黄颡鱼Tachysurus vachellii和蛇Saurogobio dabryi具有较高的COⅠ条形码遗传多样性，而贝氏Hemiculter bleekeri、光泽黄颡鱼Tachysurus nitidus和短颌鲚Coilia brachygnathus的较低。本研究验证了DNA条形码在三峡库区大部分鱼类鉴定中的有效性，同时构建了三峡库区鱼类DNA条形码数据库，评估了6个优势物种的遗传多样性，为三峡库区鱼类资源保护和管理提供了科学数据。

• 单位
  江汉大学; 生命科学学院