摘要
为了了解云南省怒江州独龙牛芽囊原虫的感染情况及基因型,试验分4个季节从怒江州怒江流域(古泉村、亚左洛村、鸠门当、茨开镇)及独龙江流域(独龙江乡)5个地点采集到987份独龙牛粪便样本,基于芽囊原虫的18S rRNA基因序列设计引物,采用常规PCR方法对粪便DNA进行扩增,琼脂糖凝胶电泳后对阳性样本进行测序分析。使用Clustal X 1.83软件和BLAST程序对测得序列在GenBank上与芽囊原虫参考序列进行同源性比对,通过MEGA-X软件计算序列之间的遗传距离,采用邻接法(NJ)构建系统进化树,以SPSS 19.0软件对感染率进行统计分析。结果表明:共得到119份芽囊原虫阳性样本,与GenBank中单峰驼芽囊原虫SSU rRNA基因序列(KC148207.1)相比,同源性为97.06%~98.92%;与牛芽囊原虫SSU rRNA基因序列(KC148205.1)相比,同源性为96.86%~98.19%,鉴定出ST10、ST14两种基因亚型。独龙牛芽囊原虫的总感染率为12.06%,其中古泉村、亚左洛村、鸠门当、茨开镇、独龙江乡感染率分别为7.28%、12.30%、19.27%、12.28%、9.20%,鸠门当采样点芽囊原虫的感染率与其他采样点比较差异显著(P<0.05)。独龙江流域与怒江流域的芽囊原虫感染率分别为9.20%、12.67%,两者比较差异不显著(P>0.05)。春夏秋冬4个季节芽囊原虫感染率分别为8.03%、11.39%、10.94%、18.22%,春季芽囊原虫感染率最低,冬季最高,两者比较差异显著(P<0.05)。说明怒江州独龙牛存在芽囊原虫感染,不同采样点的芽囊原虫感染率存在差异,冬季芽囊原虫感染率最高,需采取相应措施进行预防。
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单位基础医学院; 大理大学