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摘要
赤桉(Eucalyptus camaldulensis)为桃金娘科桉属下的一个种,抗逆性强。为了了解赤桉Ec005592基因,本研究运用一系列生物信息学方法对该基因及其蛋白进行分析,结果显示:该基因具有4个开放阅读框,分子量为47 084.15 Da,理论等电点为5.03,总亲水性平均值为-0.107,脂肪族氨基酸指数高达82.24:Ec005592蛋白中含有三个保守结构域,分别是Malectinlike结构域、Malectin结构域和LRRNT2结构域。二级结构预测得出Ec005592蛋白主要由57.71%无规则卷曲(Randon coil)、26.17%的延伸链(Extended strand)、12.15%α-螺旋(Alpha helix)和3.97%的β-转角(Beta turn)组成。三级结构的预测结果显示含有α-螺旋、β-折叠和β-转角。该蛋白质定位细胞外,包括细胞壁中,存在信号肽序列,为分泌性蛋白,共含有9个磷酸化位点。推测赤桉Ec005592蛋白为富含亮氨酸重复序列类型受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。本研究结果为今后进一步深入研究赤桉Ec005592基因的功能及其改造提供了理论基础。
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