本文以吉林省18家科技企业孵化器作为研究对象,运用数据包络分析方法,对吉林省科技企业孵化器运行效率进行分析。结果表明:吉林省孵化器运行效率总体上是中等偏上的水平;对于半数无效的孵化器,应结合自身不足,针对投入产出进行不同侧重的调整。并在此基础上,提出加强政府支持、注重人才引进和建立孵化器评价指标体系的政策建议。