鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析

作者：阎晓菲; 黄兵; 韩红玉; 杨斌; 岳城; 赵其平; 姜连连; 董辉

来源：中国畜牧兽医, 2014, 41(07): 49-53.

• 鸡
• 球虫
• 堆型艾美耳球虫
• 新基因
• 克隆
• 生物信息学

试验旨在对堆型艾美耳球虫(Eimeria acervulina)孢子化卵囊新基因EST序列进行克隆与生物信息学分析。通过RACE技术扩增从E.acervulinacDNA表达文库中筛选获得的EST序列,得到EST全长cDNA序列,利用多种生物信息学分析软件对其编码蛋白进行分析和预测。结果表明,该EST序列为E.acervulina孢子化卵囊阶段新基因,GenBank登录号为EU590120;该基因含1个492bp的开放阅读框,编码163个氨基酸,理论分子质量为17.049ku,等电点为6.69,酸性氨基酸8个,碱性氨基酸8个,分子式为C761H1223N199O219S12;总平均亲水性(GRAVY)为0.731;该蛋白有信号肽,为分泌性蛋白;具有4个跨膜结构,在105115、2832和132138位之间有很强的疏水性;具有1个蛋白激酶C磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、4个N端豆蔻酰基化位点。因此根据生物信息学全面预测和分析,发现该基因所编码的蛋白具有较多的生物学功能位点和潜在的抗原表位区域。

• 单位
  新疆农业大学科学技术学院; 农业部; 新疆农业大学; 中国农业科学院上海兽医研究所