文冠果性别分化关键期花芽转录组分析

作者：郑雅琪; 敖妍^*; 王旭; 刘阳; 刘小天; 李志虹

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(03): 1254-1267.

DOI：10.13417/j.gab.040.001254

• 文冠果
• 花芽
• 转录组
• 性别分化

为探究文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)性别分化过程的分子机制,本研究对其性别分化关键期花芽进行RNA-seq分析。结果共获得37.13 Gb原始数据,de novo组装后共产生29 430条Unigenes,平均长度1 144 bp,其中21 887条Unigenes获得功能注释。此外,共得到差异基因4 864个,其中相对于性别分化前期(Ta)差异上调基因3 003个,差异下调基因1 861个。GO富集分析显示,差异基因主要注释到代谢进程、植物激素信号转导、生长素激活的信号通路等功能。KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等生物功能。还筛选出6个MADS-box相关基因(TR576|c0g1, TR7438|c0g1,TR10037|c1g10, TR13325|c0g1, TR6316|c0g1, TR5807|c0g1),参与雄蕊发育、花粉管生长、花发育调节、花瓣发育、胚珠发育、转录因子活性等过程调节。RT-qPCR检测了16个基因在两个时期的表达量,结果均与RNA-seq一致。研究结果将为进行文冠果性别分化过程中基因表达分析提供参考。

• 单位
  省部共建森林培育与保护教育部重点实验室; 北京林业大学