龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建

作者:李浩然; 丁峰*; 张树伟; 彭宏祥; 潘介春; 何新华; 王颖; 李琳; 王金英; 黄幸; 谭春露; 徐炯志*
来源:福建农业学报, 2020, 35(09): 929-936.
DOI:10.19303/j.issn.1008-0384.2020.09.002

摘要

【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析,同时构建超表达载体。【结果】MYB14基因属于MYB-related家族的TBP-like亚家族,ORF长度831 bp,编码276个氨基酸,有一个MYB结合位点。该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞质,存在57个氨基酸磷酸化位点。其二级结构主要由无规则卷曲以及α-螺旋构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明该基因与大麻亲缘关系最近,同时成功构建了植物超表达载体pBI121-MYB14。【结论】本研究克隆得到了龙眼MYB14基因,成功构建表达载体pBI121-MYB14,为该基因功能的研究奠定了坚实的基础。

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