长链非编码RNA在宫颈癌中的表达及预后价值

作者：张丽; 罗晶; 张义晗; 李少平; 秦海霞^*

来源：中国现代医学杂志, 2020, 30(19): 15-22.

• 宫颈肿瘤
• 长链非编码RNA
• 预后
• 转录组

目的研究长链非编码RNA(lncRNA)在宫颈癌中的表达水平,鉴定在宫颈癌组织中异常表达的lncRNA,初步分析其功能,并评估其预后价值。方法宫颈癌组织和癌旁组织的转录组数据下载自癌症基因组图谱(TCGA),结合Genecode数据库中lncRNA注释信息,获取lncRNA的表达数据。通过limma软件包鉴定在宫颈癌组织和癌旁组织中差异表达的lncRNA;同时对存在差异表达的lncRNA进行生存分析和功能预测。结果在宫颈癌组织和癌旁组织中差异表达的lncRNA有554个,其中在宫颈癌组织中表达下调245个,上调309个(校正后P<0.05,倍数变化绝对值>2)。生存分析鉴定出11个与宫颈癌患者总体生存率相关的差异表达lncRNA(P<0.01)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢途径富集分析显示这些lncRNA参与到环磷酸鸟苷酸-环磷酸鸟苷酸依赖的蛋白激酶(cGMP-PKG)信号通路、钙信号通路和细胞间隙连接等肿瘤发生、发展相关代谢途径。结论通过对宫颈癌lncRNA数据的分析,鉴定11个具有预后意义的lncRNA,这些lncRNA有可能为宫颈癌治疗提供新的靶点和预后监测标志物。

• 单位
  公共卫生学院; 新乡医学院; 新乡医学院第一附属医院; 新乡医学院三全学院