生防菌Bacillus subtilis DNKAS全基因组测序及生物膜形成相关基因分析

作者：王骞; 包慧芳; 丁荣荣; 史应武; 杨红梅; 楚敏; 王宁^*

来源：草食家畜, 2022, (05): 56-64.

DOI：10.16863/j.cnki.1003-6377.2022.05.010

• 枯草芽孢杆菌
• 全基因组测序
• 比较基因组
• 生物膜

为深入挖掘和利用枯草芽孢杆菌及其基因资源,本研究利用BGISEQ-50平台对一株具有生防潜力的B. subtilis DNKAS进行了全基因组测序,通过基因组装、基因预测和功能注释,与其他8株枯草芽孢杆菌进行了比较基因组分析。结果显示:DNKAS基因组大小为4.15Mb,GC含量为43.42%,预测编码基因4 359个。在DNKAS基因组中注释到4 217个基因具有直系同源蛋白簇分类。比较基因组分析表明:DNKAS符合枯草芽孢杆菌基因组的基本特征,与其他8株枯草芽孢杆菌共有1 354个同源基因。DNKAS中与生物膜形成相关基因26个,其中编码XRE家族转录调控因子、HTH型转录调控基因等涉及生物膜通透性、脂类合成相关基因均与B. subtilis NCD-2对应的功能基因相同，两株菌在PTS系统，糖特异性IIA成分基因存在较大差异。对DNKAS全基因组序列的注释和功能分析，为深入研究其定殖特性和作用机制,并更有效地利用其防控杂草列当提供了基础。

• 单位
  新疆生产建设兵团; 新疆农业科学院微生物应用研究所