4个发育期香猪睾丸中piRNA簇的生物信息学分析

作者：马鑫芮; 冉雪琴; 牛熙; 黄世会; 王嘉福^*

来源：中国畜牧杂志, 2020, 56(10): 141-150.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20200702-03

• 香猪
• piRNA簇
• 睾丸
• 发育机制

为明确piRNA簇(Piwi-interactiing RNA Clusters)在香猪睾丸发育过程中的表达规律和调节作用,本实验选择4个发育期的雄性香猪12头:断奶期(2月龄)、初情期(3月龄)、性成熟期(6月龄)和体成熟期(12月龄),构建了4个小RNA文库,经小RNA测序,研究睾丸piRNA簇的数量、分布、来源、功能以及表达规律。结果显示:从4个发育期睾丸组织中共发现了758个piRNA簇,其中198个簇2个及2个以上发育期共表达。piRNA簇在染色体上的分布不均匀,6号、14号染色体最为密集,Y染色体上没有检测到piRNA簇。4个发育期香猪睾丸中58%以上的piRNA簇处于低丰度表达(CPM<1),转座因子(TE)衍生的piRNA簇比例随月龄增加而下降,cDNA里检测到的piRNA簇保持较高数量。对piRNA簇来源基因进行GO分析,发现主要富集于binding功能,从中发现3个piRNA簇(簇Clu-003、簇Clu-033和簇Clu-025)与精子发生相关。这些研究结果提示piRNA簇影响香猪睾丸的发育过程。

• 单位
  贵州大学; 生命科学学院; 动物科学学院