基于BSA-seq的黄褐棉纤维长度候选基因发掘

作者：陈奇; 王议萍; 陈艳; 周婉婷; 汤备; 朱心慧; 于梓璇; 李馨蕊; 汪保华^*

来源：南通大学学报(自然科学版), 2021, 20(04): 58-94.

• 黄褐棉
• 纤维长度
• 分子育种
• 极端性状混池重测序
• 候选基因

纤维长度是棉花纤维品质的重要性状之一,发掘纤维长度基因对选育优质棉花品种具有重要意义。前期研究基于一套黄褐棉导入系群体定位到15个纤维长度数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL),并分子辅助选育出一个纤维品质表现突出的黄褐棉导入系IL9,与其陆地棉轮回亲本PD94042杂交并自交构建了F2大群体。基于该群体的表型数据构建了纤维长度最长和最短的两个DNA混池,连同两个亲本共4个混池,利用极端性状混池重测序(bulked-segregant analysis sequencing,BSA-seq)方法进行遗传关联性分析,共检测到34个控制纤维长度的潜在候选基因,分别定位在Chr.7、Chr.10、Chr.18共3条染色体上的3个相关区域内。通过比较QTL定位、BSA-seq分析的结果,以及相关功能注释筛选,最终得到3个候选基因(GhD13G1294,GhD13G1295,GhD13G1296),这些候选基因可能对改良陆地棉纤维长度起重要作用。

• 单位
  生命科学学院; 南通大学