针对电能质量扰动信号种类多，特征提取精度不高，运算时间长，难以被正确分类等问题，提出一种快速S变换和LibSVM的电能质量扰动信号分类算法。在FST基础上引入调节因子提高信号时频分辨率，利用快速S变换提取扰动信号特征向量，将此向量分为训练样本和测试样本，归一化处理后输入到LibSVM进行分类，与S变换相比，具有节省运算时间，分类准确率高等优点。仿真结果表明，在样本较少的情况下加入不同信噪比的噪声，分类所用时间短、正确率高、抗干扰能力强，适合于电能质量扰动信号分类。
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