DNA宏条形码(metabarcoding)技术在浮游植物群落监测研究中的应用

作者：张宛宛; 谢玉为; 杨江华; 杨雅楠; 李娣; 张咏; 于红霞; 张效伟

来源：生态毒理学报, 2017, 12(01): 15-24.

• 浮游植物
• DNA条形码
• 生态系统健康
• 物种多样性

保护生物多样性和生态系统健康是维持生态系统功能和实现人类可持续发展的必要条件。浮游植物作为水生生态系统的初级生产者发挥着重要的生态功能,同时有毒藻类的爆发也会威胁水生态安全。然而,基于形态学的物种鉴定方法难以满足日益增长的水生态环境监测的需求。DNA条形码技术利用基因组特定基因的DNA序列来鉴别生物物种,目前已被广泛用于快速物种鉴别。然而其在水生生态系统浮游植物群落的监测中才刚刚起步。由于浮游植物物种多样性高,单基因DNA条形码往往难以识别所有浮游植物种类;近年来,采用多基因条形码、全叶绿体基因组序列的超级条形码,以及特定DNA条形码方法在浮游植物种类鉴别中有很大潜力。本文综述了浮游植物DNA条形码技术在物种鉴别研究方面的进展,以及DNA宏条形码技术(DNA metabarcoding)在水生浮游植物环境监测的应用现状及前景。

• 单位
  南京大学; 江苏省环境监测中心; 污染控制与资源化研究国家重点实验室