陆地棉GhC4H基因家族分析

作者:夏成林; 于月华; 张承琪; 陈全家; 倪志勇*
来源:分子植物育种, 2020, 18(12): 3838-3846.
DOI:10.13271/j.mpb.018.003838

摘要

肉桂酸-4-羟化酶(C4H)是苯丙烷代谢途径途径的一个重要的调控酶,在植物木质素的合成中起着重要作用。本研究通过对陆地棉基因组数据进行筛选,共鉴定得到4个GhC4H基因成员,分析发现所有成员均属于碱性蛋白质,氨基酸数目均为505,具有相似的理化性质、等电点和分子量等性状。进化树分析表明植物C4H蛋白主要分为两类。陆地棉4个GhC4H基因成员均分布于染色体的正链下方,亚细胞定位均在细胞质膜上。4个Gh C4H启动子序列中均有MBS顺式作用元件,只有一个成员没有AC顺式作用元件。4个GhC4H基因之间的Ka/Ks值均小于0.5,表明在进化过程中比较保守。通过转录组数据分析发现4个GhC4H基因在叶中相比其他组织中的表达量高,随着棉花纤维的发育4个GhC4H基因变化趋势均是从高到低。本研究为揭示陆地棉GhC4H基因家族的生物学功能提供了理论参考。

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