应用基因表达谱芯片从不同转移能力的乳腺癌细胞中筛选转移相关基因

作者：叶丽虹; 尤嘉琮; 乔玲; 蔡娜; 王长晔; 刘毅; 吴晶辉; 吴莲英; 王洪辉; 张晓东

来源：生物化学与生物物理进展, 2005, 32(5): 421-428.

DOI：10.3321/j.issn:1000-3282.2005.05.007

• 基因芯片
• 基因表达谱
• 乳腺癌
• 肿瘤转移

人乳腺癌细胞系MCF-7及其转移亚克隆LM-MCF-7为肿瘤转移分子机制的研究提供了细胞模型.应用基因芯片技术比较两种具有不同转移能力细胞系基因表达谱的差异,寻找乳腺癌转移相关基因.提取两种细胞总RNA,分别用Cy5-dCTP、Cy3-dCTP标记LM-MCF-7和MCF-7的cDNA,并与含有21 329个基因的芯片进行杂交并扫描,利用GenePixPro 4.0图像分析软件处理数据判断基因是否在两个细胞中存在表达差异.经互换荧光标记物重复两次实验,共筛选出差异表达基因67个,其中41个在LM-MCF-7细胞中表达上调,26个在LM-MCF-7细胞中表达下调.应用实时定量RT-PCR对7个表达差异明显的基因进行了验证.生物信息学分析结果提示,上述发现的差异基因编码产物与细胞内信号转导、转录调节、应激反应、新陈代谢、发育、细胞运动、细胞凋亡和细胞粘连等功能有关.据文献报道,这些差异表达的基因中有35个与肿瘤有关,其中9个与乳腺癌转移有关,6个可能参与肿瘤浸润和转移过程.根据基因芯片检测的结果,从功能上对LM-MCF-7细胞和MCF-7细胞与细胞凋亡的关系进行了研究,发现具有高转移倾向的LM-MCF-7细胞与MCF-7细胞相比,抗凋亡能力较强.上述与肿瘤转移相关基因在肿瘤转移中的作用及其分子机理有待深入研究.

• 单位
  生命科学学院; 南开大学