基于生物信息学分析Scoparone对肝癌的作用机制

作者：杨玉雯; 姚元谦; 吕建林^*; 刘英

来源：中医药导报, 2023, 29(02): 127-132.

DOI：10.13862/j.cn43-1446/r.2023.02.026

• 肝癌
• 6,7-二甲氧基香豆素
• 茵陈
• GEO芯片挖掘
• TCGA数据库
• 分子对接

目的：研究茵陈活性成分6,7-二甲氧基香豆素（Scoparone）治疗肝癌的分子机制。方法：使用GEO数据库下载肝癌的芯片数据，从TCMSP数据库检索Scoparone的作用靶点，使用R软件获取肝癌差异基因；通过Jvenn和Cytoscape3.9.1软件筛选两者交集靶点，构建蛋白互作网络，进一步使用R软件对核心交集靶点进行GO、KEGG分析；使用AutoDockTools1.5.7及AutoDockVina软件进行分子对接，对活性成分与核心靶点的结合能力进行验证；使用TCGA数据库进行核心基因的生存预后分析。结果：得到肝癌显著性差异基因1 788个、Scoparaone作用靶点100个，筛选出药物-疾病交集靶点97个。PPI拓扑分析得出的核心靶点有JAK1、JAK2、EGFR、ICAM1、KDR等。GO功能富集分析主要涉及氧化应激反应、蛋白质酪氨酸磷酸化及修饰、PI3K级联的正调节等，KEGG通路分析在主要富集在EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药机制、PI3K/Akt信号通路、上皮细胞信号传导通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等途径。分子对接验证显示，Scoparone与核心靶点间结合能<-5.0 kcal/mol。结论：Scoparone能通过调控JAK1、JAK2、EGFR、ICAM1、KDR等核心靶点，调控PI3K/Akt信号通路、上皮细胞信号传导通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等途径，从而抑制肝癌细胞的增殖、侵袭，作用机制涉及氧化应激反应过程、蛋白质酪氨酸磷酸化及修饰、ATP结合等生物功能。

• 单位
  广西中医药大学; 广西中医药大学第一附属医院