基于TCGA数据库的肝癌生物信息学分析及其预后模型的建立

作者：张鑫; 冉小柯; 赵云霞; 陈茜; 徐宗瑶; 陈晓琦^*

来源：癌症进展, 2022, 20(13): 1329-1333.

• 肝癌
• 生存分析
• 预后模型

目的 基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库，筛选肝癌发生发展相关的核心基因，构建肝癌预后风险评估模型。方法 筛选TCGA数据库中肝癌组织与癌旁组织的差异基因进行生物信息学分析，对差异基因进行Kaplan-Meier生存分析、Cox单因素分析并寻找交集基因集，对交集基因集进行Cox多因素分析寻找核心基因并构建核心基因的预后风险评估模型。结果 1836个差异上调基因主要富集于DNA结合转录激活因子活性及DNA结合转录激活因子活性，特异性RNA聚合酶Ⅱ功能上（P﹤0.0001），主要富集于神经活性配体受体相互作用、细胞周期通路上（P﹤0.0001）;77个差异下调基因主要富集于糖结合功能上（P﹤0.001）。Kaplan-Meier生存分析与Cox单因素分析得到29个交集基因，Cox多因素分析后构建了10个核心基因组成的预后模型，受试者工作特征（ROC）曲线表明预后模型预测肝癌患者预后的价值较高。结论 与肝癌的发生发展相关的10个核心基因组成的预测模型可有效判断肝癌患者预后，指导临床诊疗。

• 单位
  河南中医药大学; 第一临床医学院