脓毒症相关性脑病差异基因以及发病机制的数据分析

作者：林桦; 刘鹏; 宋程程; 秦超; 于泳浩^*

来源：国际麻醉学与复苏杂志, 2022, 43(10): 1050-1053.

• 脓毒症
• 脑病
• 基因
• 计算生物学
• 免疫炎症

目的探讨脓毒症相关性脑病(sepsis-associated encephalopathy, SAE)的相关差异表达基因(differentially expressed gene, DEG)和信号转导途径。方法基于基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)的脓毒症患者脑组织的基因组数据, 采用基因本体(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析, 以及蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析, 确定SAE的DEG。结果 DEG在免疫应答、炎症反应、凋亡过程的负调控、蛋白质水解等方面显著富集。通过PPI分析筛选出10个枢纽基因, 包括固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1, SREBF1)、细胞因子信号转导抑制因子-3(suppressor of cytokine signaling 3, SOCS3)、封闭蛋白5(claudin 5, CLDN5)、免疫球蛋白结构域蛋白4(V-set and immunoglobulin domain containing 4, VSIG4)、DNA损伤诱导蛋白45β(growth arrest and DNA damage inducible protein 45β, GADD45β)、细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule 1, ICAM1)、血管生成素-2基因(angiopoietin 2, ANGPT2)、CD14、CD163、血栓反应蛋白1(thrombospondin 1, THBS1)。结论通过生物信息学方法挖掘出与SAE相关的10个枢纽基因, 这些基因和机体的免疫炎症相关。

• 单位
  天津医科大学总医院