计算机辅助药物设计筛选嗜水气单胞菌AhyⅠ合成酶抑制剂

作者：奉玉欣; 李冰昕; 邹飘; 张耘泽; 孙维宝; 刘家璇; 宋杰; 耿辉; 熊丽

来源：微生物学通报, 2024, 51(06): 2081-2093.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.230875

• 嗜水气单胞菌
• AhyⅠ合成酶
• 群体感应抑制剂
• 计算机辅助药物设计

【背景】AhyⅠ合成酶在嗜水气单胞菌(Aromonas hydrophila)群体感应调控毒力产生中发挥着关键作用。【目的】研究其结构以寻找高效抑制剂，切断细菌致病性的源头，具有极其重要的意义。【方法】利用已解析的蛋白质结构为模板，运用同源模建和分子动力学模拟手段，成功建立了AhyⅠ合成酶的三维结构。接下来，基于先前研究的基础，选取2个高效抑制剂N-3-氧代己酰基高丝氨酸内酯(N-3-oxo-hexanoyl-homoserine lactone,NOO)和5-脱氧-5-甲硫腺苷(5'-deoxy-5'-methylthioadenosine,MTA)以及传统中药中的部分活性成分，共选取214个候选配体与受体蛋白进行分子对接。【结果】筛选出4个潜在抑制剂，经过最小抑菌浓度(minimal inhibit concentration, MIC)值、生长曲线、紫色菌素、生物膜形成、胞外蛋白酶、群集运动和泳动实验验证后，发现青蒿素可以作为嗜水气单胞菌群体感应系统的高效抑制剂。【结论】传统中药青蒿素为水产养殖业中嗜水气单胞菌的有效防治提供基础，在治疗细菌感染方面具有广阔的应用前景。

• 单位
  生命科学学院; 喀什大学; 华中师范大学