2017年北京市东城区EV-A71和CV-A16分离株VP1基因序列特征分析

作者：王联君; 李艳宇^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 32(05).

• Enterovirus 71
• Coxsackievrius A16
• VP1基因
• 进化分析

目的通过分析北京市东城区2017年手足口疑似病例样本中肠道病毒A组71(enterovirus 71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievrius A 16,CV-A16)毒株VP1基因序列特征,为手足口病的防治提供基础资料。方法利用RT-PCR法对分离得到的EV-A71和CV-A16 VP1序列进行扩增和测序,利用DNAstar5.0和MEGA6.0软件对EV-A71和CV-A16的VP1序列进行比对分析并构建系统发育树。结果 2017年东城区共检测手足口疑似病例咽拭子95份,肠道病毒阳性46份(占48.42%);其中EV-A71阳性4份(占4.21%),CV-A16阳性4份(占4.21%),非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒阳性38份(占40.00%)。4株EV-A71分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.89%～99.15%和97.32%～98.66%; 3株CV-A16分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.90%～98.76%和98.32%～100.00%。系统进化树显示4株EV-A71属于C4a基因亚型,3株CV-A16属于B1b基因亚型。结论北京市东城区2017年引起手足口病的病原主要以非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒为主,但是EV-A71和CV-A16仍占一定比例。EV-A71毒株属于C4a基因亚型;CV-A16毒株属于B1b基因亚型;与近年来中国大部分地区毒株的基因分型一致;没有检测到新亚型。