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摘要
目的 了解新疆地区旱獭（Marmota）肠道携带RNA病毒的病原本底。方法 采用宏转录组学方法对新疆喀什地区14只健康旱獭肠道样品进行病毒组分析。结果 基于重叠序列（contig）水平共注释到5个脊椎动物病毒科，分别为星状病毒科、小RNA病毒科、呼肠孤病毒科、圆环病毒科和腺病毒科。根据病毒宏转录组学结果，对注释到的病毒进行检测与进化分析，发现心病毒、嵴病毒、摩萨病毒与参考毒株同源性较高，为这些病毒变异株，而肠道病毒、腺病毒与已知病毒具有明显的遗传差异，可能为该病毒新种；星状病毒与其他旱獭源星状病毒之间氨基酸同源性差异较大，显示星状病毒在旱獭体内具有遗传多样性。值得注意的是，旱獭轮状病毒与牛轮状病毒核苷酸同源性高达92%，表明该病毒可能经过粪口途径实现跨种传播。结论 该研究揭示了旱獭肠道携带RNA病毒的多样性，为了解旱獭病毒本底、监测病毒传播生态链提供了重要数据。
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