摘要
为了解析甘草MYB转录因子在甘草发育过程中的生物学功能,本研究基于甘草基因组数据,利用生物信息学筛选甘草MYB转录因子家族成员,并分析其序列理化特性和结构、系统发育、基因复制和扩张方式、表达模式。结果表明,从甘草中共鉴定获得136个MYB基因家族成员,其大部分为酸性蛋白和亲水性蛋白。蛋白二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。亚细胞定位表明MYB蛋白全部分布在细胞核中。系统发育树分析共得到了38个亚组,其中第14亚组仅包含甘草MYB成员。进化分析表明,主要采用片段复制方式进行基因扩增,受到纯化选择。顺式作用元件分析表明其主要含有激素、逆境胁迫和生长发育相关顺式作用元件。表达模式分析发现有114个MYB基因受到MeJA的诱导,其中有7个与类黄酮合成相关。本研究为深入研究甘草MYB转录因子的功能和调控机制提供参考。
-
单位兰州金渤生物科技有限公司; 兰州交通大学