菜豆壳球孢侵染芝麻过程中内参基因的筛选

作者：赵辉; 张春艳; 文艺; 刘玉霞; 刘新涛; 倪云霞; 王飞; 刘红彦

来源：中国油料作物学报, 2017, 39(03): 393-419.

DOI：10.7505/j.issn.1007-9084.2017.03.015

• 芝麻茎点枯病菌
• qRT-PCR
• 内参基因
• 芝麻

为选择适合菜豆壳球孢(Macrophomina phaseolina)侵染芝麻过程中实时荧光定量PCR分析的内参基因,11个基因作为候选内参基因。经过PCR扩增效率筛选,β-肌动蛋白(ACTB)、泛素连接酶(UBC)、α-微管蛋白(TUBA)、γ-微管蛋白(TUBC)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、核糖体蛋白S5(RPS5-a,RPS5-b)和内部转录间隔区(ITS)8个基因符合要求,可用于稳定度筛选。利用实时荧光定量PCR技术,检测了这8个候选基因在菜豆壳球孢侵染芝麻8h、16h、24h和32h的表达情况。经Ge Norm软件分析,ACTB、GAPDH和RPS5-b等3个基因表达较稳定。经过最适内参基因数目分析,在菜豆壳球孢侵染芝麻过程中基因定量表达分析时,选择ACTB、GAPDH和RPS5-b的多基因组合作为内参,能够更准确地校正定量结果。

• 单位
  农业部; 植物保护研究所; 河南省农业科学院