萝卜SCPL3基因的克隆与生物信息学分析

作者：李紫薇; 霍燕琦; 徐铭婕; 张文静; 刘同金^*

来源：中南农业科技, 2023, 44(10): 13-16.

• 萝卜（Raphanus sativus L.）
• SCPL3基因
• 克隆
• 生物信息学

采用RT-PCR技术克隆了萝卜（Raphanus sativus L.）SCPL3基因CDS序列，并对其进行生物信息学分析。结果表明，萝卜SCPL3基因CDS序列全长1 434 bp，编码477个氨基酸，分子式为C2493H3762N632O709S21，相对分子质量为54.6 kD，理论等电点为6.33，脂肪系数为81.30，不稳定系数为39.26，平均亲水值为-0.227，是稳定亲水蛋白；亚细胞定位预测该蛋白最有可能定位于液泡，存在1个信号肽和3个跨膜结构，含有SC族羧肽酶中的S10蛋白家族结构域；系统进化分析表明其与十字花科作物SCPL蛋白同源性较高。

• 单位
  金陵科技学院