灌区可持续运行包含多层次的治理逻辑，根据国内灌区水价制度历史沿革和典型灌区现代化管理经验，科学合理的水价制度是灌区可持续运行的重要保证。灌区水价制度在实施过程中存在以下风险：农作物灌溉需求价格弹性低、地下水替代灌溉的市场失灵风险，传统惯性、旱灾频发的水价政策失灵风险，农户水价承受能力、上下游农户用水不平衡等自身因素导致的风险。基于此，提出应建立水价风险补偿基金以应对市场失灵，通过“提价补贴”、加强监管应对政策失效，建立弹性的水价调节机制以应对农户自身因素导致的风险。
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