纳米孔测序技术在病原体现场快速确认中的应用与挑战

作者：叶福强; 张锦海; 汪春晖^*

来源：中华卫生杀虫药械, 2019, 25(04): 374-378.

DOI：10.19821/j.1671-2781.2019.04.021

• 纳米孔测序
• MinION
• 病原体快速确认
• 现场检测

国外暴发的埃博拉出血热、寨卡病毒病和拉萨热疫情表明,我们亟需一种快速、有效的病原体现场检测技术来应对新发和烈性传染病。现有的二代测序平台能实现病原体快速鉴别,但对运行环境要求比较苛刻,样本制备过程相对复杂,测序运行时间较长,数据分析也依赖高性能计算设备,限制了其在非实验室环境下的现场检测应用。而作为三代测序技术代表之一的Oxford Nanopore Technologies(ONT)纳米孔测序平台具有实时、长读长、测序通量高、流转时间短、文库制备流程简易等优势,而ONT测序平台MinION更是以便携、低成本的特性而独具病原体现场快速确认的能力。本文主要对纳米孔测序技术在病原体现场快速确认中的应用与挑战进行综述。