泛凋亡因子在骨质疏松症中的诊断标记物及亚型分析

作者：丁强; 熊波; 刘金富; 田照; 容向宾; 陈立民; 陶红成; 李豪; 曾平^*

来源：中国组织工程研究, 2024, 28(28): 4505-4510.

• 骨质疏松症
• 泛凋亡
• 预测模型
• 分子亚型
• 中药预测

背景：研究推测泛凋亡可能参与了骨质疏松的病理过程，但目前尚未有泛凋亡基因在骨质疏松中的相关机制研究。目的：分析泛凋亡调节因子在骨质疏松症发生发展过程中的生物学机制。方法：从Gene Expresion omnibus(GEO)数据库中获得GSE56815数据集，提取泛凋亡基因进行差异分析。通过随机森林树模型筛选泛凋亡关键基因，构建疾病风险预测模型。运用共识聚类算法、单样本基因组富集分析以及免疫浸润分析探讨不同泛凋亡分子亚型间的差异性。通过医学本体信息检索平台Coremine medical数据库预测调节泛凋亡关键基因的中药药物。结果与结论：(1)基于4个泛凋亡关键基因(CASP1、CASP10、MEFV、TNF)，确定了骨质疏松症中的诊断标志物，构建了患病风险预测模型并进行验证；(2)将骨质疏松患者分为2种不同的泛凋亡亚型(簇A、B和基因簇A、B)，且簇B和基因簇B的泛凋亡评分分别高于簇A和基因簇A；(3)通过Coremine medical数据库预测出人参等能调节泛凋亡关键基因的中药药物。

• 单位
  广西中医药大学第一附属医院; 第一临床医学院; 广西中医药大学; 广西中医药大学附属瑞康医院