皖南牛mtDNA D-loop区遗传多样性和系统进化分析

作者：刘洪瑜; 朱一笑; 邱孝青; 方立华; 吉倩昀; 何志勇; 张运海

来源：阜阳师范大学学报(自然科学版), 2023, 40(01): 13-18.

DOI：10.14096/j.cnki.cn34-1069/n/2096-9341(2023)01-0013-06

• 皖南牛
• mtDNA
• D-loop区
• 遗传多样性
• 遗传距离

采用DNA提取及PCR扩增技术，对30头皖南母牛的mtDNA D-loop区的全序列进行扩增与分析。利用Genbank数据库，下载国内外部分黄牛品种mtDNA D-loop区的全序列，再使用Clustalx、Dnasp5.0等生物软件，对其全序列进行比对和对单倍型多样度、核苷酸多样度等展开分析。皖南牛mtDNA D-loop区序列长度均在962～1052 bp的区间内，共发现68个变异位点，其中单一信息位点共有18个，简约信息位点共有50个。构成13种单倍型，其单倍型多样性（Hd）的均值为0.6483，核苷酸多样性（Pi）的均值为0.0131，其序列之间核苷酸的差异平均数（k）为11.589,A、C、G、T碱基含量平均占比分别为33.26%,25.23%,13.39%,28.12%。通过遗传距离和N-J系统进化树得知，皖南牛和威宁黄牛、湘西牛、大别山牛和吉安黄牛亲缘关系较近。皖南牛的遗传多样性和群体变异程度较低。研究结果可为皖南牛遗传资源的保护开发提供科学依据和理论参考。

• 单位
  动物科技学院; 安徽农业大学