大口黑鲈MsDmrt3的基因结构、系统进化及时空表达

作者:生锡绘; 董浚键; 孙成飞; 李武辉; 胡婕; 田园园; 高风英; 闫宁宁; 杨超; 卢迈新; 陈刚*; 叶星*
来源:中国水产科学, 2021, 28(11): 1406-1416.
DOI:10.12264/JFSC2021-0110

摘要

基于大口黑鲈(Micropterus salmoides)全长转录组数据,克隆测序获得大口黑鲈MsDmrt3 cDNA序列,其开放阅读框为1245bp,共编码474个氨基酸,含有高保守的DM结构域和DMA结构域,且DM结构域有2个保守的锌指样结合位点。蛋白三维预测结构与人(Homo sapiens)和青鳉(Oryzias latipes)的DMRT3相似。结合大口黑鲈基因组数据分析显示,MsDmrt3位于基因组7号染色体上,基因序列长3353bp,由2个外显子与1个内含子组成。进化树聚类分析显示, Ms DMRT3属于DMRT3家族,且可能与低等节肢动物Dmrt93B起源于共同的原始DMRT。对大口黑鲈14种组织以及8个发育时期的MsDmrt3基因的表达情况进行定量分析,结果显示MsDmrt3基因在成熟个体的脊髓中高表达,精巢和眼次之,但在卵巢和肝脏几乎不表达;MsDmrt3在各发育时期均有表达,在6dpf前呈逐渐上调趋势,之后逐渐下调至最低水平。本研究表明, MsDmrt3基因序列与结构具有高保守性,且具有显著的性别表达二态性,推测其与性别决定和分化有关。同时,根据MsDmrt3基因在脊椎和胚胎发育早期的高表达,推测其可能在神经系统和胚胎早期生长发育中发挥作用。本研究旨在为大口黑鲈性别决定与性别分化分子机制的深入研究奠定基础。

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