恒河猴卵巢组织中年龄相关性差异基因的生物信息学分析

作者：冀萌萌; 谭雪梅; 余凯伦; 张秀丽; 王宗立; 陶宇昌; 刘蔓蔓; 高湛; 刘小转; 余增丽

来源：郑州大学学报(医学版), 2018, 53(03): 289-293.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2017.10.004

• 卵巢
• 老龄化
• 差异表达基因
• 恒河猴
• 生物信息学

目的:探索恒河猴卵巢组织中受年龄影响的潜在生物标志物和信号通路。方法:从GSE数据库下载基因芯片数据集GSE44533,其中包含9个恒河猴卵巢样品,共3个年龄组[青年组(3～4岁),中年组(7～8岁)和老年组(18～19岁)],每组3个样品。对3组基因表达谱中的差异表达基因进行筛选,并对筛选出的差异表达基因进行GO分析、KEGG信号通路分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。结果与结论:青年组与中年组有253个差异表达基因,中年组与老年组有68个差异表达基因,而青年组与老年组有636个差异表达基因。GO及KEGG分析结果显示,这些差异表达基因部分涉及卵母细胞减数分裂、丙酮酸代谢通路等。青年组与老年组的差异表达基因中,有6个基因(SNRNP200、DDX46、SNRNP35、DAZ2、ELAVL2、RBM46)存在细胞分子交互作用,可以作为此类研究的候选新方向。

• 单位
  郑州市第二人民医院; 郑州大学; 公共卫生学院; 河南省人民医院; 郑州大学第五附属医院