女性糖尿病周围神经病变相关基因筛选及生物信息学分析

作者：张艺; 邱珍; 夏中元^*

来源：海南医学院学报, 2020, 26(01): 53-58.

DOI：10.13210/j.cnki.jhmu.20191225.001

• 糖尿病周围神经病变
• 生物信息学
• ESR1基因
• CX3CR1基因
• FGL2基因

目的:通过对GEO数据库中糖尿病周围神经病变(DPN)相关基因芯片进行生物信息学分析,获取DPN关键基因及信号通路。方法:在GEO数据库中下载DPN相关基因芯片,利用R语言分析DPN女性患者与正常对照组的差异基因(DEGs)并进行可视化,根据基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对差异基因进行注释,预测其功能与相关通路,利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络筛选核心基因。结果:分析芯片GSE95849获取差异基因4 746个,其中上调基因2 218个,下调基因2 528个。其中TFAP2C、ESR1、CX3CR1、FGL2处于蛋白质相互作用核心位点。结论:差异基因主要参与MAPK通路,通过血糖稳态、炎症作用、神经元发育等参与DPN发病过程,为DPN的诊断及治疗提供新的思路。

• 单位
  武汉大学人民医院