基于线粒体DNA D-loop全序列的麒麟鸡遗传多样性研究

作者：李威娜; 郭美慧; 温锦添; 翁茁先; 陈洁波; 杜炳旺; 黄勋和^*

来源：广东农业科学, 2023, 50(04): 100-107.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2023.04.012

• 麒麟鸡
• 线粒体DNA(mtDNA)
• D-loop全序列
• 遗传多样性
• 系统进化

【目的】从线粒体DNA(mtDNA) D-loop全序列角度评估麒麟鸡的遗传多样性水平，以期阐明麒麟鸡的品种形成。【方法】通过PCR产物直接测序法对麒麟鸡保种群的黄羽、白羽和黑羽3个资源群及8个地方鸡品种进行mtDNA D-loop全序列测定，分析遗传变异，并进行中性检测，构建单倍型中介网络图，探究麒麟鸡的群体历史。【结果】麒麟鸡mtDNA D-loop全序列为1 231～1 232 bp,C+G含量（39.8%）低于T+A含量（60.2%），总体核苷酸多样性为0.00630±0.00054，明显高于其他8个地方鸡品种。3个资源群黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型多样性分别为0.777±0.076、0.816±0.060、0.710±0.057，核苷酸多样性分别为0.00699±0.00115、0.00662±0.00090、0.00546±0.00062，遗传多样性水平基本上与群体规模呈正相关。麒麟鸡与8个地方鸡的双参数遗传距离为0.008～0.009，净遗传距离为0.003～0.005，均大于其他地方鸡之间的遗传距离。90份麒麟鸡样本共检测到45个突变位点，定义了17个单倍型，其中独享型单倍型9个，单倍型多样性为0.773±0.039。黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型数量分别为12、7、5个。8个地方鸡品种定义了19个单倍型，其中河田鸡的单倍型数量最多（8个），宁都黄鸡的最少（3个），没有与麒麟鸡共享的单倍型。中性检测结果显示，除了黑羽麒麟鸡外，供试鸡种在品种水平上近期均未经历明显的种群扩张。麒麟鸡单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E，优势单倍型类群是B(30.0%)和E(64.4%);8个地方鸡单倍型类群主要为A和B。【结论】独特的单倍型提示麒麟鸡具有独立的品种形成历史，相对较高的遗传多样性水平将有利于其保护和利用工作的开展。

• 单位
  嘉应学院; 生命科学学院