5株水禽细小病毒全基因组序列分析

作者：贺亦龙; 邵周伍林; 白小飞; 张云

来源：畜牧兽医学报, 2014, 45(11): 1837-1843.

• 鹅细小病毒
• 番鸭细小病毒
• NS基因
• VP基因
• 序列分析

利用PCR技术扩增鹅细小病毒(GPV)ZJ、G3和LJY毒株与番鸭细小病毒(MDPV)DK和DYL毒株全基因组。序列分析结果表明,除LJY毒株非结构基因(NS)编码626个氨基酸外,其余4株NS全长1 884bp,编码627个氨基酸;5株的结构基因(VP)全长均为2 199bp,编码732个氨基酸。GPV、MDPV NS蛋白不同毒株之间相似性分别为95.9%99.8%和96.8%99.0%;而GPV与MDPV NS蛋白之间相似性为88.9%90.4%。GPV、MDPV VP蛋白不同毒株之间的相似性分别为90.2%100.0%和96.9%99.3%,而GPV与MDPV VP蛋白之间的相似性为79.5%81.6%,表明GPV抗原性不同于MDPV。MDPV与GPV NS蛋白均含有4个潜在的糖基化位点;在结构蛋白区域,MDPV VP含有8个潜在的糖基化位点,而GPV为6个糖基化位点,G3与LJY毒株分别缺失582—584NTT和703—705NRT潜在的糖基化位点。5株水禽细小病毒的进化分析表明,GPV、MDPV在进化上形成两个独立的分支,各个基因片段之间未发生重组。

• 单位
  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 兽医生物技术国家重点实验室