应用数据集GSE63514和GSE67522对宫颈癌关键基因的筛选研究

作者：王晓旋; 马雪艳; 刘云春

来源：井冈山大学学报(自然科学版), 2022, 43(03): 34-40.

• 宫颈癌
• 生物信息学
• 关键基因

通过DAVID网站进行上调基因的GO分析，借助STRING工具建立上调基因的蛋白-蛋白相互作用网络图(PPI)，使用Cytoscape软件里的MCODE插件筛选出宫颈癌关键基因；借助基因表达谱交互分析数据库（GEPIA）和人蛋白质数据库（HPA）探讨宫颈癌关键基因在宫颈癌组织的表达及预后情况。通过两个数据集获取12个共同上调基因，筛选出TRIP13、ATAD2、POLQ、KIFC1、EXO1、MELK、RMI2、KNTC1、UHRF1这9个关键基因；GO功能富集分析提示宫颈癌关键基因功能的作用主要集中在DNA修复、免疫球蛋白基因的体细胞超突、链置换反应及DNA合成修复等过程中；基因验证结果提示：筛选的9个宫颈癌关键基因在宫颈癌组织的表达均较正常组织高（P<0.05）;EXO1、KNTC1、RMI2与患者不良预后相关；免疫组化结果显示KNTC1、RMI2在宫颈鳞癌组织表达较癌旁组织高。本研究通过生物信息学筛选出的与宫颈癌相关的9个关键基因，期待成为宫颈癌诊断和治疗的潜在靶点，并为功能性实验的开展提供理论依据。

• 单位
  基础医学院; 大理大学