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摘要
目的 获得半边旗Pteris semipinnata L.叶绿体基因组序列信息，明确其叶绿体基因组的结构特点和系统进化关系。方法 通过高通量测序技术进行半边旗叶绿体基因组的测序，使用生物信息学方法对其进行组装和注释，分析其密码子偏好性、简单重复序列，比较其与近缘物种的序列变异，并构建系统进化树。结果 半边旗叶绿体基因组大小为162 270 bp，为环状双链四分体结构，包括81 963 bp的大单拷贝区，21 125 bp的小单拷贝区，以及两个29 591 bp的反向重复区。半边旗叶绿体基因组共注释到131个基因，其中蛋白编码基因88个，rRNA基因8个，tRNA基因35个。半边旗叶绿体基因组偏好使用以A/T碱基结尾的密码子，且检测到的59个简单重复序列中，以A或T碱基的单核苷酸重复为主。序列比对和系统进化分析显示半边旗与同属植物井栏边草、蜈蚣草同源性最高。结论 该研究丰富了蕨类药用植物的叶绿体基因组资料，也为半边旗的物种鉴别、遗传多样性和进化发育等可持续性研究奠定了基础。
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单位基础医学院; 第一临床医学院; 广东医科大学
