菜心BcFLC1的SNP变异与选择性剪接

作者：陶鹏; 赵彦婷; 钟新民; 岳智臣; 雷娟利; 李必元^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(22): 7429-7435.

DOI：10.13271/j.mpb.018.007429

• 菜心(Brassica papachinensis)
• BcFLC1
• SNP变异
• 选择性剪接

为探讨菜心极易抽薹开花的分子机制,本研究以早熟类型的‘四九菜心’为研究材料,参考大白菜基因组分析了菜心开花抑制基因BcFLC1的转录组SNP情况,鉴定了3个纯合SNP位点。其中一个SNP定位在6号内含子(I6)的剪接供体位点"GT"上,在菜心中突变为"AT"。研究发现菜心BcFLC1剪接位点变异导致其在pre-mRNA加工中发生了选择性剪接,产生了6种剪接异构体,并分析了每种剪接方式的频率。预测了菜心6种BcFLC1剪接异构体的蛋白产物,显示这些蛋白产物均异常,缺失6号或7号外显子以及氨基酸片段的插入。最后比较了大白菜、结球甘蓝以及菜心中FLC1的SNP变异与选择性剪接。本研究分析了菜心BcFLC1的SNP变异及其诱导的选择性剪接的特征,为阐释了菜心极易抽薹开花的分子机制提供了理论依据。

• 单位
  浙江省农业科学院