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摘要
目的 预测核受体结合SET域蛋白1催化活性区域(NSD1-CD)B细胞优势表位，并分析其功能。方法 以NSD1-CD的氨基酸序列为基础，利用生物信息学软件，采用Hopp&Woods亲水性方案、Zimmerman极性参数、Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等，进一步运用抗原指数预测，并结合三级结构分析NSD1-CD B细胞优势表位及其功能。结果 NSD1全长为2 696个氨基酸，NSD1-CD(1 852～2082)由231个氨基酸组成，相对分子质量为26.53 k Da。经综合分析，NSD1-CD B细胞优势表位可能存在于NSD1全长序列N端的1 865～1 869及1 959～1 964区段，优势表位KKPPP(1 865～1 869)距离s-腺苷甲硫氨酸较近，可能与转甲基功能关系紧密。结论 多参数预测NSD1-CD B细胞优势表位可为应用多肽小片段制备单克隆抗体、表位疫苗及研究其蛋白功能提供重要的依据。
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单位宁波市医疗中心李惠利医院; 宁波大学
