摘要
细菌性肠炎在水产养殖过程中频繁发生,然而细菌性肠炎的确切机制尚不十分清楚。本研究旨在鉴定与嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染诱导的肠炎相关的新候选基因,以嗜水气单胞菌感染唇?(Hemibarbus labeo)为材料,利用BGISEQ-500平台,对其肠道进行转录组测序。结果显示,测序共获得120 173个unigene,平均长度为1 328 bp,组装质量指标N50为2 647 bp,其中72.71%为已知基因。差异表达基因筛选发现,嗜水气单胞菌感染后共有33 706个基因显著差异表达,其中18 878个基因上调,14 828个基因下调。通过GO富集分析发现,差异表达基因主要富集于细胞过程、代谢进程、生物调控、细胞、细胞组分和结合等。通过KEGG富集分析发现,差异表达基因主要富集于信号转导、免疫系统、癌症和传染病等信号通路。差异表达基因分析和qPCR验证显示,抗菌肽基因铁调素(hepcidin)、肝表达抗菌肽2 (liver-expressed antimicrobial peptide 2, leap2)和炎症细胞因子基因白细胞介素1β (interleukin-1β, IL-1β)、肿瘤坏死因子-α (tumor necrosis factor-α, TNF-α)、IL6和IL8的表达在嗜水气单胞菌感染后显著上调。化学合成Hepcidin、LEAP2和细胞溶素(NK-lysin)并检测了其对嗜水气单胞菌的抗菌活性,发现Hepcidin和LEAP2可以有效抑制嗜水气单胞菌的繁殖。本研究为进一步了解唇?和其他养殖鱼类细菌性肠炎的致病机制提供了基础数据。
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单位动物科学学院; 浙江大学; 丽水学院