氨基甲酸乙酯水解酶的家族生物信息学分析

作者：张献; 彭涛; 张耀; 李若熙; 杨丽娟^*

来源：生物信息学, 2022, 20(01): 64-74.

• 氨基甲酸乙酯
• 氨基甲酸乙酯水解酶
• 生物信息学
• 结构预测

氨基甲酸乙酯(Ethyl carbamate, EC)是酒精饮料生产过程中自然产生的副产物，具有潜在的致癌性和遗传毒性，成为影响人们健康的隐患。利用氨基甲酸乙酯水解酶(Urethane hydrolase, UH)消除酒精饮料中已存在的EC具有直接、高效的作用。为了进一步探索EC水解酶的功能与作用，本实验利用生物信息学的方法对已注释的EC水解酶进行其氨基酸序列的理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜结构域、蛋白质的二级、三级结构及功能域进行预测分析，并将EC水解酶蛋白进行多序列比对分析。结果表明，EC水解酶基因编码472～551 aa,分子量在50～62 kD之间，理论等电点(pI)在5左右，均为酸性亲水性蛋白，无跨膜区和信号肽。二级结构预测结果显示EC水解酶的氨基酸都以α螺旋以及无规则卷曲为主，螺旋与折叠排列有序。此外，使用同源建模的方法对EC水解酶进行模型的构建，预测结果质量评估均较好，并使用同源比对的方法，分析出EC水解酶高保守氨基酸残基。这些分析与预测为挖掘新的EC水解酶、进一步研究EC与EC水解酶结合位点以及对EC水解酶的改造提供了理论依据。

• 单位
  四川轻化工大学