利用小RNA深度测序技术鉴定江苏盐城辣椒病毒种类

作者：赵小慧; 刘冲; 郁凯; 钟明娟; 郑佳秋; 邢锦城^*

来源：江苏农业学报, 2023, 39(01): 37-43.

• 辣椒
• 小RNA深度测序
• 病毒病

2019年6月江苏省盐城市发生了较为严重的辣椒病毒病，危害症状表现为植株重度矮化、叶片黄化、蕨叶甚至畸形。将采集的11株疑似感染病毒的辣椒植株叶片研磨成浆液，再用其摩擦接种本氏烟植株，发现用其中3株辣椒的叶片浆液摩擦接种本氏烟植株后，本氏烟植株出现病毒侵染的典型症状，初步判断这些辣椒被病毒感染，但不能确定其种类和归属。为了进一步明确辣椒感染的病毒类型，将3株辣椒样品混成2份样品利用小RNA深度测序技术和生物信息学分析法进行检测，结果发现样品1被蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)、苜蓿花叶病毒(Alfalfa mosaic virus, AMV)和辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus, ChiVMV)3种病毒复合侵染，从样品2中检测到BBWV2 1种病毒，通过RT-PCR检测验证了这一结果的可靠性。最后利用RT-PCR方法对田间采集的11份辣椒样品和接种的本氏烟植株进行毒源鉴定，其中2株辣椒样品及其接种的本氏烟叶片上鉴定出了BBWV2、ChiVMV和AMV,这3种病毒侵染辣椒在江苏省均为首次发现。研究结果为对江苏省辣椒构成潜在严重威胁的病毒的早期诊断和及时防控提供了参考。

• 单位
  江苏沿海地区农业科学研究所