低亚氨基在胶原异源三聚体中倾向性的测定

作者：刘晗; 郑虹宁; 张瑞雪; 许菲^*

来源：华中农业大学学报, 2020, 39(03): 105-112.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2020.03.014

• 胶原蛋白
• 氨基酸倾向性
• 胶原异源三聚体
• 主-客体模型
• 稳定性预测
• 圆二色谱
• 低亚氨基序列
• 发生频率

为解析不同类型氨基酸残基对天然胶原热稳定性的影响,以更贴近天然胶原序列中低亚氨基的异源三聚体abc为研究主体,设计不同的突变胶原序列,以圆二色谱法测定不同氨基酸对胶原热稳定性的影响,即倾向性。同时统计了天然胶原序列中各氨基酸的出现频率,并基于氨基酸倾向性计算预测了天然Ⅰ型胶原蛋白的局部热稳定性值。结果显示:X位的Ala、Leu和Glu、以及Y位的Gln、Thr、Ala和Arg既具有较高的倾向性,又具有较高的出现频率;天然Ⅰ型胶原蛋白序列可分为2种类型的区域:一种是可促进二级结构形成的高稳定性区域:另一种是对某些生命过程起到关键作用的低稳定性区域;同时具备高热稳定性和高出现频率的氨基酸,对天然胶原蛋白的稳定性起到关键作用。

• 单位
  生物工程学院; 江南大学