阿拉伯哲学具有理性主义的哲学方法论特征,因为它已经具有了构成它的基本要素:理性主义的内在精神,形式结构和基本原理。但是,在12-13世纪以后,特别是以苏菲派为代表的宗教哲学思想成为主流意识形态以后,理性主义的发展过程就转变了它原来的发展方向。阿拉伯哲学方法论抛弃了理性主义而走向了神秘主义,与东方其他民族文明的哲学方法论观念和思维传统逐步接近,完成了它在其逻辑历史发展过程中的两次转变。