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摘要
为探讨长链非编码RNA在青花菜高温和盐胁迫中的功能。以青花菜高代自交系‘WN12-95B’为试验材料，通过RNA-seq测序、靶基因注释和qRT-PCR分析，筛选出与青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA。在青花菜高温和盐胁迫文库中鉴定到2432条LncRNAs,筛选获得158个差异LncRNAs,其中96个上调表达，62个下调表达。序列特征分析发现LncRNAs的长度较mRNA短，外显子个数也比mRNA少。靶基因注释显示差异LncRNAs可通过谷胱甘肽代谢、信号转导以及氧化磷酸化等参与青花菜高温和盐胁迫响应。qRT-PCR分析结果显示10个挑选的差异LncRNAs在盐胁迫和高温胁迫中的表达趋势各具特点。 XLOC＿033957、 XLOC＿034964、 XLOC＿005515、 XLOC＿027154、 XLOC＿023592和 XLOC＿035830在高温胁迫下呈现先下降再上升的模式，但在盐胁迫中其表达模式存在差异。 XLOC＿033671、 XLOC＿003826、 XLOC＿06988和 XLOC＿024730在盐胁迫下呈持续上调表达，在高温胁迫下先上升后下降。通过测序及数据分析，鉴定出青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA的相关基因，为进一步分析LncRNAs在青花菜高温和盐胁迫下的调控机制提供一定的基础。
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单位温州科技职业学院; 昆明学院; 生命科学学院
