摘要
为研究滇黄精(Polygonatum kingianum Coll. et Hemsl.)根茎腐病主要致病菌尖孢镰刀菌PkF01孢子萌发的分子机制,收集萌发0 h、12 h和24 h的孢子进行转录组测序分析。共获得68.31 Gb Clean data,检测到表达基因14777个,表达转录本23884个。组间两两对比合计获得差异表达基因6126个,其中上调表达基因3317个,下调表达基因3282个。GO分析发现大部分DEGs注释在生物进程中代谢过程,分子功能中催化活性和细胞成分中细胞部分;KEGG分析发现大部分DEGs注释在代谢中碳水化合物代谢,遗传信息处理中折叠、分类和降解,环境信息处理中信号转导,细胞过程中运输和分解,有机系统中衰老。对上调和下调表达基因分别进行功能富集分析,发现大部分差异表达基因显著富集在核糖体相关的GO条目和KEGG通路中。此外,GATA型锌指蛋白家族基因FOXG_08613和热激转录因子家族基因FOXG_08113在孢子萌发过程中显著下调表达,而MADS-box转录因子FOXG_05887在孢子萌发过程中显著上调表达。研究结果为筛选该病原真菌潜在的关键生长发育基因和致病基因奠定基础,为滇黄精根茎腐病的防控提供线索。
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