基于花脸香蘑基因组的SSR分子标记开发

作者：李雪松; 华蓉; 孙达锋; 岳万松; 尚陆娥; 刘绍雄^*

来源：北方园艺, 2023, (02): 112-120.

• 花脸香蘑
• 基因组
• SSR
• 标记开发

以4个花脸香蘑菌株及已公布的花脸香蘑基因组为试材，采用生物信息学和试验验证相结合的方法，研究了花脸香蘑基因组上的SSR类型及分布，设计了50对SSR引物开展试验验证，以期为花脸香蘑的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供参考依据。结果表明：总计检索到7种SSR类型的2 486条序列，其中主要以单碱基(P1)类型为主，占总SSR的67.70%,且分布密度较高；四、五、六碱基重复的类型较多，但数量较少。由验证试验获得4对多态性高、重复性好、特异性好的引物，分别为HLMSSR001、HLMSSR004、HLMSSR015和HLMSSR041。其中，HLMSSR001和HLMSSR004可以通过单一的引物扩增即可将4个花脸香蘑菌株进行区分鉴定。同时，基于4对引物进行花脸香蘑DNA指纹编码的构建，获得了4个花脸香蘑菌株唯一的8位数分子指纹数据库编码。

• 单位
  中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所