基于重测序番茄InDel标记的开发

作者:张国儒; 唐亚萍; 杨涛; 帕提古丽; 王柏柯; 李宁; 王娟; 李晓琴; 余庆辉; 杨生保*
来源:分子植物育种, 2019, 17(14): 4692-4697.
DOI:10.13271/j.mpb.017.004692

摘要

番茄基因组测序的完成为InDel标记的开发提供了很多的研究基础。为了鉴别渐渗系‘IL71’和栽培种‘M82’之间的差异,本研究经过前期对栽培种‘M82’和野生型潘那利渐渗系‘IL71’进行重测序结果比较,结果表明,这两份番茄材料在12号染色体上存在较大差异。因此从存在较大差异的12号染色体上设计了1 980对In Del标记引物,以便用分子标记的方法区别两份材料。本研究从中筛选出400对引物进行InDel标记检测,最终检测出40对特异性引物,检出率为10%。本研究结果为今后的杂交种检测提供依据。

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