38例临床患者留置导尿管的微生物群落多样性分析

作者：李丁; 陈豪特; 杨小琴; 王忠; 甘辛^*

来源：遵义医科大学学报, 2022, 45(03): 377-382.

DOI：10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2022.0049

• 泌尿道感染
• 留置导尿管
• 16S rRNA
• 肠球菌
• 铜绿假单胞菌

目的 通过研究患者导尿管样品中微生物群落构成，探索感染相关的潜在风险因素。方法 收集2020年11～12月期间西苑医院38例患者留置的导尿管。提取样品中的细菌总DNA,PCR扩增16S rRNA V4-V5区。利用Hiseq 2500测序平台进行测序，数据使用skewer、FLASH等软件进行细菌群落结构及多样性分析。结果 38例患者平均年龄为(82.1±7.2)岁，导尿管平均留置时间为(25.50±9.66)d。有效序列1 603 007条，有效序列长度在382bp至442bp之间，共得到11 350个OTUs和1,668,076个优质序列。S1-S5时间段分组，各组样品中革兰氏阴性菌所占比例均高于阳性菌，36个样品存在含量>50%的优势菌门，占全部样品的86.8%。结论 导尿管为相对封闭环境，微生物群落具有特定性，导尿管中菌群变化规律总体上与留置时间相关，长留置时间可能导致高度单一菌群结构出现。

• 单位
  中国中医科学院西苑医院; 国家食品安全风险评估中心; 卫生部食品安全风险评估重点实验室